Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDN1P05305 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDN1P05305 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDN1P05305 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDN1P05305 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms