Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGRMC1O00264 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGRMC1O00264 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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