Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP23O00161 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms