Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L4J1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L4J1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L4J1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms