Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms