Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms