Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms