Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms