Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRBP1Q9P2E9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms