Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHPF2Q9P2E5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms