Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms