Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKDREJQ9NTG1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms