Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms