Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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