Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSSK1BQ9BXA7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK1BQ9BXA7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms