Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms