Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms