Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS8Q99627 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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