Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGAP1Q96PV0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms