Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NLRP3Q96P20 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLRP3Q96P20 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLRP3Q96P20 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLRP3Q96P20 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLRP3Q96P20 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLRP3Q96P20 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLRP3Q96P20 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms