Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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