Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms