Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MED12Q93074 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MED12Q93074 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MED12Q93074 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MED12Q93074 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms