Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms