Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MCOLN3Q8TDD5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms