Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPC24Q8NBT2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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