Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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