Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC91Q7Z6B0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms