Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFWD3Q6PCD5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms