Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KHDC3LQ587J8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms