Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FHOD3Q2V2M9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms