Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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