Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PFKFB3Q16875 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PFKFB3Q16875 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms