Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms