Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DDR2Q16832 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms