Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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RTN1Q16799 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTN1Q16799 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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