Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms