Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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DDB1Q16531 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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