Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK3Q16288 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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