Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAM2Q15035 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms