Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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