Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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