Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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