Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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