Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1SQ13698 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms