Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms