Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMAD4Q13485 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMAD4Q13485 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMAD4Q13485 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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