Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CLN3Q13286 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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