Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NR5A1Q13285 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms