Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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